MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Caulobacter sp. K31 plasmid pCAUL02

Total Repeats: 3455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010333	GCG	2	6	302	307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
2	NC_010333	CGG	2	6	314	319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
3	NC_010333	CCG	3	9	326	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621563
4	NC_010333	GCA	2	6	431	436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621563
5	NC_010333	GAT	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621563
6	NC_010333	CGC	2	6	476	481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621563
7	NC_010333	GAT	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621563
8	NC_010333	CCGA	2	8	619	626	25 %	0 %	25 %	50 %	167621563
9	NC_010333	CCA	2	6	671	676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621563
10	NC_010333	GCA	2	6	677	682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621563
11	NC_010333	CGGC	2	8	740	747	0 %	0 %	50 %	50 %	167621563
12	NC_010333	TC	3	6	806	811	0 %	50 %	0 %	50 %	167621563
13	NC_010333	CCA	2	6	824	829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621563
14	NC_010333	GCC	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621563
15	NC_010333	GCG	2	6	925	930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
16	NC_010333	GCC	2	6	981	986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621563
17	NC_010333	GCTC	2	8	1211	1218	0 %	25 %	25 %	50 %	167621563
18	NC_010333	CGT	2	6	1262	1267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621563
19	NC_010333	GCCA	2	8	1309	1316	25 %	0 %	25 %	50 %	167621563
20	NC_010333	GAG	2	6	1328	1333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167621563
21	NC_010333	GAT	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621563
22	NC_010333	GCG	2	6	1385	1390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
23	NC_010333	CG	3	6	1435	1440	0 %	0 %	50 %	50 %	167621563
24	NC_010333	CG	3	6	1449	1454	0 %	0 %	50 %	50 %	167621563
25	NC_010333	GGC	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
26	NC_010333	GCG	2	6	1557	1562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
27	NC_010333	GCG	2	6	1578	1583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621563
28	NC_010333	CGC	2	6	1734	1739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621563
29	NC_010333	GCA	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621563
30	NC_010333	GAT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621563
31	NC_010333	GCG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621564
32	NC_010333	CCT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621564
33	NC_010333	GCC	2	6	2149	2154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621564
34	NC_010333	CCA	2	6	2191	2196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621564
35	NC_010333	CGC	2	6	2211	2216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621564
36	NC_010333	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621565
37	NC_010333	CGC	2	6	2741	2746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
38	NC_010333	GCG	2	6	2799	2804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621565
39	NC_010333	GC	3	6	2824	2829	0 %	0 %	50 %	50 %	167621565
40	NC_010333	GAG	3	9	2868	2876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167621565
41	NC_010333	GGC	2	6	2907	2912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621565
42	NC_010333	TGC	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621565
43	NC_010333	CTC	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621565
44	NC_010333	CG	3	6	2955	2960	0 %	0 %	50 %	50 %	167621565
45	NC_010333	CGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621565
46	NC_010333	GGC	2	6	3033	3038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621565
47	NC_010333	GCT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621565
48	NC_010333	GC	3	6	3104	3109	0 %	0 %	50 %	50 %	167621565
49	NC_010333	GCC	2	6	3127	3132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
50	NC_010333	CGC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
51	NC_010333	CTG	2	6	3267	3272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621565
52	NC_010333	ACC	2	6	3351	3356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621565
53	NC_010333	GCC	2	6	3357	3362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
54	NC_010333	GCC	2	6	3399	3404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
55	NC_010333	TCG	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621565
56	NC_010333	CGA	2	6	3440	3445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621565
57	NC_010333	CGCTG	2	10	3446	3455	0 %	20 %	40 %	40 %	167621565
58	NC_010333	GCC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621565
59	NC_010333	TCT	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621565
60	NC_010333	CAC	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621565
61	NC_010333	GCC	2	6	3570	3575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621566
62	NC_010333	CG	3	6	3588	3593	0 %	0 %	50 %	50 %	167621566
63	NC_010333	GC	3	6	3611	3616	0 %	0 %	50 %	50 %	167621566
64	NC_010333	GCC	2	6	3621	3626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621566
65	NC_010333	TCG	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621566
66	NC_010333	CTC	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621566
67	NC_010333	GCA	2	6	3708	3713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621566
68	NC_010333	ACG	2	6	3720	3725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621566
69	NC_010333	CGT	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621566
70	NC_010333	TCC	2	6	3770	3775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621566
71	NC_010333	GCC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621566
72	NC_010333	TCCGGC	2	12	3821	3832	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	167621566
73	NC_010333	CG	3	6	3899	3904	0 %	0 %	50 %	50 %	167621566
74	NC_010333	ATG	2	6	3946	3951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621566
75	NC_010333	CG	3	6	4412	4417	0 %	0 %	50 %	50 %	167621567
76	NC_010333	GGT	2	6	4593	4598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621567
77	NC_010333	GAT	2	6	4618	4623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621567
78	NC_010333	CCT	2	6	4647	4652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621567
79	NC_010333	CTT	2	6	4696	4701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621567
80	NC_010333	GCC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621567
81	NC_010333	TG	3	6	4730	4735	0 %	50 %	50 %	0 %	167621567
82	NC_010333	GTG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621567
83	NC_010333	GCC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621567
84	NC_010333	GAT	2	6	4900	4905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621567
85	NC_010333	TTC	2	6	5058	5063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621567
86	NC_010333	GTC	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621567
87	NC_010333	CGT	2	6	5340	5345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621567
88	NC_010333	TCT	2	6	5387	5392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621567
89	NC_010333	CGA	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621567
90	NC_010333	TGAT	2	8	5438	5445	25 %	50 %	25 %	0 %	167621567
91	NC_010333	GTG	2	6	5500	5505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621567
92	NC_010333	TCC	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621567
93	NC_010333	TCC	2	6	5606	5611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621567
94	NC_010333	GATC	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	167621567
95	NC_010333	TCAA	2	8	5701	5708	50 %	25 %	0 %	25 %	167621568
96	NC_010333	AAT	2	6	5810	5815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621568
97	NC_010333	CGG	3	9	5919	5927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621568
98	NC_010333	ACC	2	6	5981	5986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621568
99	NC_010333	CAG	2	6	6058	6063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621568
100	NC_010333	CG	3	6	6101	6106	0 %	0 %	50 %	50 %	167621568
101	NC_010333	GCC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
102	NC_010333	CGC	2	6	6243	6248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
103	NC_010333	CCA	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621568
104	NC_010333	CGT	2	6	6315	6320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621568
105	NC_010333	GCG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621568
106	NC_010333	GCT	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621568
107	NC_010333	TCA	3	9	6468	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621568
108	NC_010333	CGT	2	6	6477	6482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621568
109	NC_010333	TCC	2	6	6508	6513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621568
110	NC_010333	GCC	2	6	6515	6520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
111	NC_010333	TTC	2	6	6547	6552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621568
112	NC_010333	GA	3	6	6555	6560	50 %	0 %	50 %	0 %	167621568
113	NC_010333	GCC	2	6	6598	6603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
114	NC_010333	GC	3	6	6619	6624	0 %	0 %	50 %	50 %	167621568
115	NC_010333	CG	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	167621568
116	NC_010333	CCT	2	6	6750	6755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621568
117	NC_010333	CGC	2	6	6768	6773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
118	NC_010333	CCA	2	6	6832	6837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621568
119	NC_010333	GGC	2	6	6901	6906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621568
120	NC_010333	GC	3	6	6935	6940	0 %	0 %	50 %	50 %	167621568
121	NC_010333	CCG	2	6	6947	6952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621568
122	NC_010333	ACC	2	6	6965	6970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621568
123	NC_010333	GCGGTC	2	12	6979	6990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	167621568
124	NC_010333	GGTCCA	2	12	7102	7113	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	167621568
125	NC_010333	AGC	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621568
126	NC_010333	GCCC	2	8	7285	7292	0 %	0 %	25 %	75 %	167621568
127	NC_010333	CGG	2	6	7317	7322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621568
128	NC_010333	TCG	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621569
129	NC_010333	CG	3	6	7386	7391	0 %	0 %	50 %	50 %	167621569
130	NC_010333	CAG	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621569
131	NC_010333	AGCC	2	8	7477	7484	25 %	0 %	25 %	50 %	167621569
132	NC_010333	GC	3	6	7491	7496	0 %	0 %	50 %	50 %	167621569
133	NC_010333	CAT	2	6	7510	7515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621569
134	NC_010333	TCG	2	6	7518	7523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621569
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137	NC_010333	GTC	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621569
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250	NC_010333	GCA	3	9	12035	12043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621573
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253	NC_010333	CCGT	2	8	12277	12284	0 %	25 %	25 %	50 %	167621573
254	NC_010333	CG	3	6	12328	12333	0 %	0 %	50 %	50 %	167621573
255	NC_010333	TCG	2	6	12433	12438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621573
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257	NC_010333	GTTCAT	2	12	12546	12557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	167621573
258	NC_010333	GCG	2	6	12566	12571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621573
259	NC_010333	CCGGC	2	10	12573	12582	0 %	0 %	40 %	60 %	167621573
260	NC_010333	CAC	2	6	12618	12623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621573
261	NC_010333	GCA	2	6	12646	12651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621573
262	NC_010333	GCG	2	6	12661	12666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621573
263	NC_010333	TGG	2	6	12680	12685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621573
264	NC_010333	GCA	2	6	12722	12727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621573
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390	NC_010333	GCC	3	9	18275	18283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621578
391	NC_010333	CGC	2	6	18362	18367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621578
392	NC_010333	CCGC	2	8	18396	18403	0 %	0 %	25 %	75 %	167621578
393	NC_010333	TGGCC	2	10	18419	18428	0 %	20 %	40 %	40 %	167621578
394	NC_010333	CGC	2	6	18453	18458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621578
395	NC_010333	GCCCGG	2	12	18496	18507	0 %	0 %	50 %	50 %	167621578
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399	NC_010333	GCC	2	6	18720	18725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621579
400	NC_010333	GGC	2	6	18779	18784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621579
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500	NC_010333	TCC	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621587

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